1、胚胎因素
胚胎染色体异常导致流产占早期流产病因的50%-60%，因为大部分人并不知道自身是否携带基因遗传疾病，而到医院进行试管的患者首次试管基本以一代、二代技术为主，因此并没有在第一次尝试时就利用三代技术来提前筛查胚胎质量，所以会产生因胚胎质量差导致的流产。
2、母体因素
母体方面的因素包括：全身性疾病、生殖器官疾病、内分泌异常、强烈应激、免疫功能异常、不良生活习惯等。
3、父亲因素
主要为精子染色体异常，还包括精子碎片率过高。精液常规检查正常不等于精子质量没问题，该检查能够大体上反应精子质量，但是对不育患者的原因分析和生育力评估上是存在的一定局限，30%的男性不育患者精液常规结果是正常的，但是生孩子的愿望很难实现。随着检测技术的发展，人们逐渐认识到精子功能存在缺陷也是导致男性不育很重要一个原因，而精子DNA碎片率也是反映精子功能重要检测之一，跟精子DNA损伤有关。
4、外界因素
主要包括环境的污染、辐射源接触、有毒物质感染等。
实际上以上几大类因素不仅是导致怀孕后生化、胎停、流产的重要原因，也是试管中胚胎培育失败或移植失败的关键原因。因此，医生会根据患者的实际周期情况，来进行分析和检测，找出是哪一个主要因素导致的流产。从而才能对症下药。目前国内外医学专家针对流产会进行以下操作：
筛查排除找出最终病因
①流产原因中50%-60%的原因是染色体原因，占了最大的比例，检查流产物染色体问题可帮助进一步诊断，如检查后不是染色体层面的问题，则从其他方面“凝血、免疫、影像”再进行排查。
②查找“种子”问题，胚胎的发育好比种子的发育，期间受环境影响，种子本身则更为重要，流产物染色体检测，就是查找“种子”的问题，并进一步给出指导性建议。
如果是胚胎染色体质量问题，则建议患者选择第三代试管婴儿技术来进行助孕。
③患者要避免焦虑，很多孕妇因为中途流产，甚至反复性流产后思想压力巨大，甚至有放弃怀孕的想法，这完全没有必要，现代医学完全可以通过有效有效监测来找出病因，避免这种情况的发生。
偶发流产可能是优胜劣汰
偶发的生化妊娠如果检查没有发现明确的染色体缺陷，多为胚胎本身质量不好，或者偶然因素导致受精卵染色体变异，因而产生了妊娠终止，这表明人类胚胎也遵循着优胜劣汰的规律，大约有70%的胚胎会被最终自然淘汰，有些胚胎没有发育到能着床的阶段就被淘汰了，生化妊娠后妊娠的丢失率约30%（其中不包括临床妊娠流产）。因此生化妊娠或胎停在某种意义上是一种优胜劣汰的自然选择。
多次流产夫妻建议做全面检查
三次以上的流产建议夫妻双方应该进行全面系统检查，如双方的染色体检查及女方的免疫因素、性激素、甲状腺功能、宫腔检查、子宫腔的情况、免疫系统、凝血功能等，查出原因，积极配合治疗，为下一次的备孕做好准备。
胎停、流产后多久再次尝试怀孕
一般来讲，出现过胎停育的女性，从优生的角度考虑，过三个月时间可以再次怀孕。给女性的卵巢、子宫、身体和心理一个恢复的时间，然后检查各项指标正常后，可再次尝试新一个周期的试管婴儿。
接受试管婴儿治疗的不孕不育患者对是否胎停育不必过分担心，这种现象即使是自然受孕也会出现，并不是说试管婴儿会加大这种风险，一般而言，只要患者多加注意对身体的调理和保护，都会顺利生下宝宝的。
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